随着科技的不断进步，现代汽车配备了越来越多的智能系统和先进的功能来提高效率和驾驶体验。其中，自动启停（Stop-Start）系统是一种常见的节能技术，它能够在车辆静止时关闭发动机以节省燃料，并在驾驶员踩下油门时重新启动发动机。然而，这项技术的复杂性有时可能导致系统故障或逻辑错误，特别是在新车还在制造商提供的保修期内的时候。那么，如果一辆新车在其保修期内出现了自动启停系统的逻辑错误，车主是否应该为此支付维修费用呢？

首先，我们需要了解新车保修期的概念以及它涵盖的范围。通常情况下，新车保修期是指从新车交付给消费者之日起的一定时间内或者行驶里程达到一定限度之前，制造商对其产品提供免费维修或更换零部件的服务期限。这个服务是出于保证产品质量和对消费者负责的目的而设立的。一般来说，新车的基本保修期为3年或10万公里左右，但也有可能因品牌、车型和其他因素而有差异。

其次，关于自动启停系统的逻辑错误，这可能涉及到软件编程的问题或者是传感器等硬件设备的故障。对于这样的问题，大多数情况下，如果是在保修期内发现的且不是由于用户不当操作或其他外部原因造成的，那么按照正常的保修政策，应该是由厂家承担相应的维修费用。这是因为，作为一项标准配置的技术，其稳定性应当得到保障，并且在设计开发阶段就应该充分考虑到各种可能的故障情况并进行相应的测试和优化。

然而，在实际操作中，具体的处理方式可能会因为不同品牌的售后政策和消费者的购车合同条款而有所区别。例如，一些品牌可能会要求车主先将车辆送到授权经销商处进行检查和诊断，然后再确定责任归属；另一些品牌则可能在车主报告问题后直接安排免费维修。此外，即使是在同一品牌的不同国家和地区，也可能存在不同的保修政策和服务流程。因此，当遇到此类问题时，建议车主与当地经销商或制造商联系，以便获取最准确的信息和建议。

总的来说，如果在保修期内发现新车上的自动启停系统存在逻辑错误或者其他功能性问题，在没有明确的证据表明是由用户不当操作或其他外部原因造成的情况下，理论上应由厂家承担相应的维修费用。但是，为了确保权益不受损害，车主应保留好所有相关证据（如维修记录、检查报告等），并与厂家或经销商保持沟通，以确保问题的顺利解决。